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数据可视化
数据可视化
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数据可视化是关于数据视觉表现形式的科学技术研究。其中,这种数据的视觉表现形式被定义为,一种以某种概要形式抽提出来的信息,包括相应信息单位的各种属性和变量。
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在世界地图上标注单倍型分布
单倍型分布
R语言
世界地图标注
学习如何利用R语言在世界地图上优雅地标注单倍型分布,了解种群遗传结构、迁移模式和进化历史研究中的关键步骤。安装必要的R包并操作示例数据,掌握如何准备数据、运行代码来展示单倍型的分布情况。
崔耳又又
2024-8-23
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数据可视化
批量显著性分析及作图
作图代码
数据准备
了解如何使用批量显著性分析和作图代码,为你的材料之间的多个性状数据进行显著性分析提供帮助。包括数据准备、作图代码示例和使用R包等内容。
崔耳又又
2024-8-20
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数据可视化
使用ID号进行多组数据按需求匹配合并
ID号数据匹配
学习如何使用ID号来合并不同组的数据,提供解决此问题的逻辑和代码方案,以及社群讨论参与,帮助您更轻松地处理数据合并和匹配的任务。
小杜的生信笔记
2024-7-23
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数据可视化
DNA/RNA/氨基酸多序列比对图R包ggmsa
本文介绍了如何使用R包ggmsa进行DNA/RNA/氨基酸多序列比对图的生成,并提供了安装ggplot2和ggmsa的方法,以及导入内置核酸序列的示例代码。
生信与基因组学
2024-7-6
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数据可视化
多因素因素独立预后分析 | 随机森林图绘制
Cox分析
本教程介绍了多因素独立预后分析和随机森林图绘制的方法,以及相关的Cox分析和数据处理代码。欢迎查看教程获取更多相关内容。
小杜的生信笔记
2024-6-30
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数据可视化
单因素独立预后分析,随机森林图绘制教程
教程
R包
数据导入
本篇教程介绍了如何进行单因素独立预后分析并绘制随机森林图的方法,内容涉及R包的加载和数据导入。教程还包括了往期教程部分内容,并在前言中讨论了在医学研究中的应用场景。想要了解更多相关内容,请查看详细分析代码。
小杜的生信笔记
2024-6-30
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数据可视化
使用ggplot绘制柱状图,在柱子中显示数值和显著性
ggplot柱状图
显著性
发芽数
天数
发芽指数
通过使用ggplot绘制柱状图并在柱子中显示数字和显著性,了解如何计算发芽数和天数得出发芽指数。本教程还包括往期教程内容和代码示例,帮助您学习基于ggplot的柱状图绘制技巧。记得设置「小杜的生信笔记」为星标,获取最新推文教程信息。
小杜的生信笔记
2024-6-28
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数据可视化
基于TBtools做基因家族分析 | 生信部分 | 三
**
小杜的生信笔记
2024-6-27
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数据可视化
基于TBtools做基因家族分析 | 生信部分 | 二
TBtools
基因家族分析
Figtree
进化树
生物信息学
了解如何基于TBtools进行基因家族分析,使用Figtree绘制进化树,掌握进化树的美化方法以及图形合并技巧。此外,还可以学习如何通过GFF或GTF文件进行目的基因注释,以及利用TBtools进行图形颜色的调整和单张出图的方法。
小杜的生信笔记
2024-6-27
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数据可视化
基于TBtools做基因家族分析 | 生信部分 | 一
基因家族分析
TBtools
生信工具
Pfam数据库
HMMER
本文介绍了使用TBtools进行基因家族分析的过程,通过Pfam数据库和HMMER工具获得基因家族的同源基因,然后使用TBtools提取目的基因序列并进行motif分析。通过该教程可以了解如何应用生物信息学工具进行基因家族分析,提高基因功能研究的效率。
小杜的生信笔记
2024-6-27
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数据可视化
cWGCNA包(因果WGCNA):一个利用 WGCNA 进行因果推断的 R 包
CWGCNA
WGCNA
R package
causality inference
machine learning
CWGCNA is a powerful R package that provides causality inference in gene co-expression network analysis and offers various functions for bioinformatics analysis, such as feature selection, multi-omics clustering, and classification using machine learning
小杜的生信笔记
2024-6-27
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数据可视化
Nature开源 | 学习RNA和scRNA分析,提供全部代码
Nature开源
RNA分析
scRNA分析
生信笔记
转录组分析
Nature开源提供学习RNA和scRNA分析的全部代码,包括转录组上游和下游分析教程。欢迎关注「小杜的生信笔记」,免费获取2021年11月以来的知识分享教程,配备实例数据和相关代码。```
小杜的生信笔记
2024-6-27
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数据可视化
跟着Nature Metabolism学作图 | 柱状堆积图
Nature Metabolism
学作图
柱状堆积图
R语言绘图教程
这期教程介绍了在Nature Metabolism学习制作柱状堆积图的内容,包括R语言绘图教程等。欢迎一起学习、总结和分享!
小杜的生信笔记
2024-6-24
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数据可视化
hdWGCNA | 单细胞(scRNA)和空间转录组共表达网络分析
hdWGCNA
单细胞RNA-seq
空间转录组学
HDWGCNA是用于单细胞RNA-seq或空间转录组学等高维转录组学数据中执行加权基因共表达网络分析的工具。学习如何使用hdWGCNA包进行分析,获取所需数据,并加载相关数据集和库。详细信息请查看链接。
小杜的生信笔记
2024-6-24
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数据可视化
cWGCNA包(因果WGCNA):一个利用 WGCNA 进行因果推断的 R 包
CWGCNA
因果WGCNA
R包
生物学探索
CWGCNA是一个R包,用于进行因果WGCNA分析,可以帮助鉴定共表达基因模块及其与表型性状相关性。该工具结合了中介模型与WGCNA,能够找到模块、模块特征和表型之间的因果关系。CWGCNA还包含了机器学习部分,可对多组学数据进行聚类和分类。欢迎了解更多关于CWGCNA的功能和代码运行。
小杜的生信笔记
2024-6-24
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数据可视化
比较基因组:点图介绍与可视化
比较基因组
基因组点图
基因组可视化
了解如何使用基因组点图进行比较分析,可视化基因组之间的相似性和差异性,发现基因组重排和重复序列,寻找基因和功能元素,在基因组注释和比较基因组学研究中发挥重要作用。使用minimap2进行基因组比对,并通过dotPlotly进行可视化,探索基因组结构、功能和演化关系。
数据科学工厂
2024-6-23
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数据可视化
R语言绘制基因结构变异位置图绘制方法
trackViewer包
了解如何使用R语言中的trackViewer包绘制基因结构与变异位置图,通过Lolliplot棒棒糖图功能可视化甲基化、突变体和基因组突变位置等数据,支持多组学数据的便捷可视化分析。安装该功能强大的包时需注意Bioconductor及BiocManager进行安装。
生信分析笔记
2024-6-20
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数据可视化
R语言ggplot2复现CELL论文中的基因共线性图
R语言
ggplot2
基因共线性图
本文介绍了如何使用R语言的ggplot2包,利用论文中的数据复现基因共线性图。文章还提供了作图所需的代码和手动整理的数据。若需了解更多数据分析和数据可视化内容,欢迎关注“小明的数据分析笔记本”公众号。
小明的数据分析笔记本
2024-6-19
777
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数据可视化
绘制带P值的差异柱状图
绘图
差异柱状图
生信笔记
R语言绘图教程
转录组分析
查看「小杜的生信笔记」中关于绘制带P值的差异柱状图的教程和代码示例,学习如何使用R语言进行转录组分析及绘图。免费获取从2021年11月开始更新的全部教程,配备示例数据和相关代码。
小杜的生信笔记
2024-6-16
376
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数据可视化
R语言绘图 | 使用ggplot2绘制热图,指定显示基因和旋转
R语言绘图
ggplot2
热图
基因
旋转
学习如何使用ggplot2库在R语言中绘制热图,指定显示基因并进行旋转。此文提供了绘图代码和示例数据,帮助您快速掌握热图绘制技巧。点击链接查看更多详情。
小杜的生信笔记
2024-6-12
506
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