遗传学 - ResBang生信交流网

遗传学是研究基因的结构、功能及其变异、传递和表达规律的学科。包括GWAS、QTL定位、BSA等分析手段。

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人类进化历程：40亿年的演变之路

人类进化历程原细胞哺乳动物大猿智人物种

探索40亿年的人类进化历程，从原细胞到智人物种的演变之路。了解人类进化的关键阶段，包括原始细胞、哺乳动物、大猿等重要发展阶段。观察人类进化可能带来的未来变化，预测人类种群的生理和认知能力在未来会发生的显著变化。

数据科学工厂 2024-11-5 71 0 0 0 遗传学
求助ssr四倍体毛细电泳遗传多样性分析

ssr四倍体毛细电泳

了解ssr四倍体毛细电泳遗传多样性分析，探讨在四倍体条件下的数据解读和分析方法，解决遇到的bp型数据引物扩增异常问题。

isms_mkt3OTDn 2024-8-24 197 1 0 0 遗传学
单基因遗传疾病 | 遗传性耳聋

遗传性耳聋耳聋基因检测

了解遗传性耳聋的细胞学机制和遗传方式，包括常染色体隐性遗传、常染色体显性遗传、线粒体遗传以及伴性遗传。掌握常见的耳聋致病基因如GJB2、GJB3、SLC26A4、MT-RNR1，以及对患者的影响和相关疾病综合征。及早进行耳聋基因筛查有助于提前干预和管理耳聋症状。

生信与基因组学 2024-9-1 363 0 0 0 遗传学
单基因遗传疾病 | 脆性X综合征

脆性X综合征 FXS FMR1基因智力障碍遗传风险

脆性X综合征是一种常见的单基因遗传疾病，主要表现为智力障碍和社交障碍，由X染色体上FMR1基因的异常导致。了解遗传风险及检测方法对于早期诊断和干预至关重要。采用PCR-毛细血管电泳和甲基化敏感的Southern印迹杂交等方法可进行快速且准确的诊断。

生信与基因组学 2024-9-1 361 0 1 0 [1人赞] 遗传学
群体遗传进化与选择分析：Pi、Fst、TajimaD、XP-CLR计算方法

群体遗传进化 Pi Fst TajimaD XP-CLR计算方法

了解群体遗传进化与选择分析中的Pi、Fst、TajimaD、XP-CLR计算方法，掌握正选择、负选择和平衡选择的概念，以及核酸多样性Pi在衡量核苷酸多样性和推演进化关系中的重要性。学习如何使用vcftools批量计算Pi并利用ggplot2画图进行数据可视化。

生信分析笔记 2024-8-18 1192 0 7 0 [7人赞] 遗传学
多序列比对

[md]# 蛋白序列多重比较构建进化树 ## Phylogenetic analyses of NLRs The polypeptide sequences of various disease resistance genes from Triticum spp. and related genera were aligned using Muscle v5.1 s ...

在博学生信 2024-6-28 191 0 0 0 遗传学
构建系统发育树简述

系统发育树进化关系构建方法

系统发育树代表生物进化关系的假设，可以通过形态学、生化或分子特征构建。文章介绍了构建系统发育树的基本原理和方法，以及如何推断物种之间的进化历史。通过比较基因或蛋白质序列，可以揭示物种之间的关系，为系统发育树的构建提供重要依据。

数据科学工厂 2024-6-24 282 0 0 0 遗传学
系统发育树初步剖析

系统发育树生物体进化分支模式

了解系统发育树及其在确定生物体进化关系和相关性中的重要作用。探索系统发育树的构建过程，以及如何使用不同特征来分析和比较物种间的关系。系统发育树是假设而非确定答案，随着新数据的加入会不断修订和更新。

数据科学工厂 2024-6-24 283 0 0 0 遗传学
生信教程:ABBA-BABA分析之滑动窗口

[md]动动发财的小手，点个赞吧！ ## 简介 ABBA BABA 统计（也称为 D 统计）为偏离严格的分叉进化历史提供了简单而有力的检验。因此，它们经常用于使用基因组规模的 SNP 数据测试基因渗入。虽然最初开发用于基因 ...

数据科学工厂 2024-6-21 308 0 0 0 遗传学
生信教程：使用全基因组SNP数据进行ABBA-BABA分析

[md]动动发财的小手，点个赞吧！ ## 简介 ABBA BABA 统计（也称为“D 统计”）为偏离严格的分叉进化历史提供了简单而有力的测试。因此，它们经常用于使用基因组规模的 SNP 数据（例如来自全基因组测序或 RADseq） ...

数据科学工厂 2024-6-21 269 0 0 0 遗传学
生信教程：使用拓扑加权探索基因组进化（3）

[md]动动发财的小手，点个赞吧！使用 Twisst 探索整个基因组的进化关系的拓扑加权[教程](https://github.com/simonhmartin/tutorials/blob/master/topology_weighting/README.md "Source")。 ## 简介拓扑加权是 ...

数据科学工厂 2024-6-21 276 0 0 0 遗传学
生信教程：使用拓扑加权探索基因组进化（2）

[md]动动发财的小手，点个赞吧！使用 Twisst 探索整个基因组的进化关系的拓扑加权[教程](https://github.com/simonhmartin/tutorials/blob/master/topology_weighting/README.md "Source")。 ## 简介拓扑加权是 ...

数据科学工厂 2024-6-21 186 0 0 0 遗传学
生信教程：使用拓扑加权探索基因组进化（1）

[md]动动发财的小手，点个赞吧！使用 Twisst 探索整个基因组的进化关系的拓扑加权[教程](https://github.com/simonhmartin/tutorials/blob/master/topology_weighting/README.md "Source")。 ## 简介拓扑加权是 ...

数据科学工厂 2024-6-21 188 0 0 0 遗传学
生信教程|最大似然系统发育推断

生信教程 IQ-TREE 系统发育分析

了解如何使用IQ-TREE进行最大似然系统发育推断的生物信息学教程。通过此教程，您将学习如何运行最大似然搜索以生成系统发育树，并了解如何评估节点可靠性以及如何应用替代模型进行分区分析。跟随教程操作，您将轻松掌握基因序列比对和系统发育分析技术。

数据科学工厂 2024-6-20 269 0 0 0 遗传学
PSMC 推断种群规模变化

PSMC 种群规模变化

通过PSMC模型推断种群规模变化的历史，使用基因组数据分析工具进行数据处理和分析。详细教程包括索引数据、一致序列调用、PSMC运行和绘图等步骤。利用单染色体FASTQ文件合并和转换格式等技术完成数据准备，最终绘制出反映种群规模演化的PSMC图。

数据科学工厂 2024-6-20 404 0 0 0 遗传学
生信教程：使用全基因组SNP数据进行ABBA-BABA分析

生信教程 ABBA-BABA分析

了解如何使用全基因组SNP数据进行ABBA-BABA分析的生物信息学教程。通过学习基因渗入测试和D统计量计算，探究物种间的基因交流与杂交现象。详细介绍数据集、流程、假设以及全基因组基因渗入测试方法。

数据科学工厂 2024-6-14 289 0 0 0 遗传学
生信教程|最大似然系统发育推断

IQ-TREE 分析序列比对替代模型

本文介绍如何使用最大似然系统发育推断的程序IQ-TREE进行序列比对的分析，包括节点可靠性评估、未链接替代模型应用以及多基因对齐等。了解IQ-TREE的多个选项和功能，以及如何指定其他替代模型来进行分析。

数据科学工厂 2024-6-14 341 0 0 0 遗传学
利用VCF文件构建系统发育树

VCF文件系统发育树 VCF2Dis 距离矩阵 mat2nwk

本文介绍利用VCF文件构建系统发育树的多种方法，包括VCF2Dis软件的安装和距离矩阵生成，mat2nwk文件转换，以及使用iTOL美化进化树；另外，还介绍了使用Phylip进行系统发育推断的过程，包括安装、格式转换和建树等步骤。通过详细的操作指南，帮助读者快速学习和应用这些工具来构建系统发育树。

数据科学工厂 2024-6-8 845 0 1 1 [1人赞] 遗传学
TAD calling 之 insulation score 分析

TAD insulation score 计算方法实战 FAN-C

本文介绍了TAD insulation score的定义、计算方法和实战操作，其中详细描述了使用FAN-C来计算insulation score，包括安装、计算、绘图等步骤。

数据科学工厂 2024-6-7 606 0 0 0 遗传学
使用plink软件+EMMAX软件做GWAS分析的完整实例

本文详细介绍了如何使用plink软件和EMMAX软件进行GWAS分析的完整实例，配有阿里云服务器购买链接及所需软件下载链接。涵盖了流程、相关软件及输入数据的准备方式，帮助读者掌握GWAS分析的关键步骤。

小明的数据分析笔记本 2024-6-4 1318 0 2 0 [2人赞] 遗传学

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