遗传学 - ResBang生信交流网 - 第2页

遗传学是研究基因的结构、功能及其变异、传递和表达规律的学科。包括GWAS、QTL定位、BSA等分析手段。

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学习Nature正刊论文中eQTL分析前对基因表达量的预处理

eQTL分析 Nature论文 RNA-seq数据 peer包

该论文介绍了在eQTL分析前对基因表达量进行的预处理步骤，包括RNA-seq数据的处理和标准化方法。详细介绍了使用data.table包中的fread函数读取大型表达量数据的步骤，并通过示例代码展示了对数据进行过滤、标准化和运行peer的具体操作。此外，论文还提供了相关数据的下载链接，为进行类似研究的科研工作者提供了有用的参考资源。

小明的数据分析笔记本 2024-5-30 362 0 1 0 遗传学
评估 beagle 基因型填充的准确率

准确率 vcf文件缺失数据 SNP数据染色体3

了解如何评估beagle基因型填充的准确率，包括过滤vcf文件中的缺失数据、用随机选取的样本和位点替换成缺失，使用SNP数据比较填充前后一致性。此外，了解如何使用python脚本和snakemake来进行数据处理和统计平均值，并掌握相关的生物信息学知识。关注小明的数据分析笔记本公众号获取更多相关内容。

小明的数据分析笔记本 2024-5-29 781 0 0 0 遗传学
基于ColabFold网站，使用alphafold2进行蛋白互作预测（含PYMOL使用方法）

使用ColabFold和AlphaFold2在线网站进行蛋白结构和互作预测，配合PYMOL软件展示预测结果及互作区域。详细介绍了在ColabFold上的操作步骤和PYMOL的使用方法。

崔耳又又 2024-5-27 1492 0 2 0 [1人赞] 遗传学
快速从基因组中提取基因、转录本、蛋白、启动子、非编码序列

基因组提取转录本序列 CDS序列蛋白序列启动子序列

提供方法和代码示例，快速从基因组中提取基因、转录本、蛋白、启动子等各种序列类型，通过使用gffread软件和bedtools软件，结合fasta格式的基因组序列和gtf或gff格式的基因注释文件，实现基因组数据的高效提取。

Bioleader 2024-5-11 1075 0 1 1 遗传学
DNAsp进行群体单倍型分析

了解如何使用DNAsp进行群体单倍型分析，包括多序列比对、DNA多态性和Tajima's test的步骤和结果。

Bioleader 2024-5-9 667 0 0 0 遗传学

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