测序 - ResBang生信交流网

一代测序、二代测序、三代测序、ONT测序等的原理和方法。

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fq测序数据损坏怎么办

了解如何修复损坏的测序数据并恢复数据完整性，通过提取未损坏部分和统一双端数据，采用有效的修复方法，确保数据质量和一致性。

崔耳又又 2024-8-3 355 2 0 0 [2人赞] 测序
ATAC-seq数据分析（二）

fragment 分布 TSS 富集质控

了解如何进行ATAC-seq数据分析中的质控流程，包括绘制fragment分布图和评估TSS附近的富集程度。学会使用samtools、bamCoverage、R语言等工具进行片段长度提取、bigwig文件转化、矩阵计算和绘制热图。介绍了手动计算方法以及ATACseqQC工具包的简要说明。

生信菜鸟屋 2024-7-22 255 0 1 0 [1人赞] 测序
ATAC-seq数据分析（一）

ATAC-seq 数据分析调控元件基因表达过滤

本文介绍了ATAC-seq的作用及其数据分析流程，包括过滤、比对等步骤。ATAC-seq能够获得染色质的开放区域，进而获得调控元件，从而调控某些基因的表达，是一种非常有利的测序方法。同时，文章还提到了一些注意事项，建议大家使用fastp的默认参数，并选择合适的片段长度进行比对，最后进行QC检测。

生信菜鸟屋 2024-7-22 290 0 1 0 [1人赞] 测序
二代测序原理

二代测序原理 Illumina测序仪生物信息分析

学习二代测序原理是了解生物信息分析的重要基础，illumina公司的测序仪采用简单原理进行DNA序列合成，利用光信号转换为碱基。了解文库结构可帮助区分不同样本并实现高效测序数据获取。

生信菜鸟屋 2024-6-6 434 0 0 1 测序

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ATAC-seq数据分析（二）

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