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数据可视化
数据可视化
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数据可视化是关于数据视觉表现形式的科学技术研究。其中,这种数据的视觉表现形式被定义为,一种以某种概要形式抽提出来的信息,包括相应信息单位的各种属性和变量。
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R语言做生态位分化分析(3)一个真实的小例子
R语言
Patera nantahala
Gastropoda
Polygyridae
genomics
本文介绍了使用R语言进行生态位分化分析的一个真实例子,数据和代码来源于一篇论文。论文标题是Using genomics, morphometrics, and environmental niche modeling to test the validity of a narrow-range endemic snail, Patera nantahala (Gastropoda, Polygyridae)。文章提供了相关数据和代码的链接,可以通过这些链接获取所需的数据和代码。对于进行该分析,需要准备两个
小明的数据分析笔记本
2024-6-12
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数据可视化
用R语言的ggplot2包复现一下Nature正刊论文中的气泡图
通过R语言中的ggplot2包,以Nature正刊论文中的气泡图为例,介绍如何实现Figure4a图表。文章讨论了曲线线段与函数参数设置的问题,并提供了解决方案。同时,还包括对转录组数据处理流程的介绍,以及丰富的示例数据和作图代码。
小明的数据分析笔记本
2024-6-11
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数据可视化
用R语言的circlize包复现一下Microbiome期刊中的圈图
R语言
circlize包
Microbiome期刊
圈图
otu表格
本文介绍如何利用R语言中的circlize包复现Microbiome期刊中的圈图,并提供了数据整理和作图的具体方法。该图涉及到otu表格、Hu sheep lambs等内容,对于喜欢数据可视化和相关研究的读者有参考价值。
小明的数据分析笔记本
2024-6-10
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数据可视化
R语言做生态位分化分析(2)找找参考论文
R语言
论文
数据复现
通过R语言进行生态位分化分析,寻找相关论文以及提供的数据和代码,探讨对结果的描述。了解如何使用ENMtools包中的identity.test()函数。了解关于蜗牛和冠状病毒的环境数据研究,欢迎关注《小明的数据分析笔记本》公众号,分享数据分析、数据可视化、基因组学等内容。
小明的数据分析笔记本
2024-6-8
504
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数据可视化
R语言做双侧威尔克森(Wilcoxon)配对符号秩检验简单小例子
R语言
代码
论文数据处理
组学数据
本文介绍了使用R语言进行双侧威尔克森配对符号秩检验的简单小例子,示例数据来源于特定论文,提供了论文中组学数据处理流程的代码链接。同时介绍了关于警告信息的解决方法。
小明的数据分析笔记本
2024-6-7
712
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数据可视化
R语言里将vcf文件转换为GenAlEx格式数据
R语言
vcf文件
GenAlEx格式
poppr包
genlight object
本文介绍了如何使用R语言将vcf文件转换为GenAlEx格式数据,并提供了相关链接和代码示例。还介绍了如何使用poppr包进行主成分分析,以及安装和加载所需的R包。
小明的数据分析笔记本
2024-6-3
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数据可视化
R语言里做生态位分化分析(1)背景知识查询
R语言
ENMTools
geodata
世界气候数据
bioclimatic
本文介绍了在R语言环境中使用ENMTools和geodata进行生态位分化分析的方法,包括获取环境数据和世界气候数据的过程。ENMTools提供了用于生态位分化分析的函数`identity.test()`,而geodata则可以帮助获取环境数据。另外还介绍了世界气候数据中包含的19个bioclimatic数据,并提供了相关的下载方法。
小明的数据分析笔记本
2024-6-2
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数据可视化
常用生信在线网站集锦
RNA分析工具
获取最新的生物信息学工具,包括RNA二级结构分析、蛋白互作网络研究和基因共表达网络等工具,轻松查询基因信息并进行序列分析。
Bioleader
2024-5-11
532
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