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R是用于统计分析、绘图的语言和操作环境。R是属于GNU系统的一个自由、免费、源代码开放的软件,它是一个用于统计计算和统计制图的优秀工具。
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R中无法安装GitHub包 | 花费大量时间的小小经验
R包安装问题
R网络问题
本文记录了解决R包无法安装的经验,涵盖了网络问题、下载包无法安装等情况,提供了一些解决方案和建议。同时还分享了一些相关的生物信息学教程链接。
小杜的生信笔记
2024-7-23
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R语言
R语言无法调用stats.dll的问题解决方案
R语言
解决方案
错误信息
R包
本文讨论了R语言无法调用stats.dll的问题,包括问题的起因、报错信息以及解决方案。提供了针对该问题的解决方法,并介绍了如何挂载新的R包文件夹以及相关操作步骤。
小杜的生信笔记
2024-7-23
449
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R语言
ClusterProfiler包进行KEGG富集报错
ClusterProfiler
KEGG富集
报错
R版本
兼容性
本文介绍了使用ClusterProfiler包进行KEGG富集分析时遇到的报错问题,与R版本升级及兼容性有关。提供了两种解决方法,并强调了版本间的兼容性需提高。
小杜的生信笔记
2024-7-23
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R语言
学生及科研人员电脑配置推荐 | 笔记本+外置显卡配置,性能足够支持完成你博士论文文本
学生
科研
电脑配置
推荐
外置显卡
为学生及科研人员提供电脑配置推荐,包括笔记本配合外置显卡,性能足够支持完成博士论文等工作。了解更多关于外置显卡配置的信息和优势。
小杜的生信笔记
2024-7-23
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R语言
Science期刊论文中画地图展示采样地点的代码
期刊论文
画地图
采样地点
数据下载链接
经纬度范围
本篇期刊论文介绍了如何在科学研究中使用代码画地图展示采样地点,提供了数据下载链接和相关地图绘制代码。文章涉及地形、河流信息、省界绘制以及地理坐标转换等内容,也包括解决画地图过程中可能遇到的问题和参考资料。
小明的数据分析笔记本
2024-7-21
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R语言
R语言ggplot2散点图组合频率分布直方图完整实例
R语言
ggplot2
散点图
频率分布
实例
本文介绍了使用R语言和ggplot2创建散点图组合频率分布直方图的完整实例,并提供了论文来源和部分实例数据截图。文章展示了加载所需的R包、读取数据和绘制频率分布直方图、散点图的步骤,同时演示将三个图进行组合的过程。欢迎关注作者的公众号“小明的数据分析笔记本”,了解更多关于数据分析、数据可视化以及生物信息学等内容。
小明的数据分析笔记本
2024-7-20
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R语言
在写项目或修改材料时,还为自己的字体与别人的字体不一致而烦恼吗?| 常用办公字体享
电脑字体格式
学习如何解决电脑中常用办公字体不一致的问题,避免下载字体时的困扰,了解如何安装适用于办公环境的字体包,以确保文档格式统一。欢迎关注《小杜的生信笔记》获取更多技巧与教程!
小杜的生信笔记
2024-7-17
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R语言
R语言ggplot2柱形图组合热图
R语言
ggplot2
数据可视化
利用R语言的ggplot2包进行柱形图组合热图数据可视化,数据来源于论文,展示了多个类别的平均相对丰度数据。示例代码和示意图帮助更好理解ggplot2的使用方法。
小明的数据分析笔记本
2024-7-17
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R语言
可视化结构变异的R包SVbyEye
bioinformatics tool
**: SVbyEye is a bioinformatics tool for visualizing structural variations in R, designed to aid in the analysis and interpretation of genetic data. Explore its functionalities and usage on its GitHub repository, and refer to the provided documentation fo
小明的数据分析笔记本
2024-7-15
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R语言
R语言包EGAD用来评估基因共表达网络的表现
R语言包EGAD
EGAD R包
本文介绍了R语言包EGAD用于评估基因共表达网络的表现,以及利用桃子转录组数据构建基因共表达网络的研究。同时还提到了另一篇关于使用公共转录组数据构建葡萄基因共表达网络的论文,以及相关的机器学习算法和代码资源。欢迎关注公众号“小明的数据分析笔记本”,内容涵盖R语言和python的数据分析与可视化、园艺植物转录组学和生物信息学等主题。
小明的数据分析笔记本
2024-7-14
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R语言
跟着NC学作图:R语言circlize包做弦图展示基因组特征
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小明的数据分析笔记本
2024-7-9
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R语言
跟着NC论文学数据分析:R语言gradientForest包分析环境变量的重要性排序
SNP 位点预测
R 包安装教程
本文详细介绍了如何使用 R 语言中的 gradientForest 包进行环境变量的重要性排序分析,并提供了相关代码和教程链接。内容包括从 VCF 文件计算等位基因频率的方法,如何处理环境数据和等位基因频率表,以及 gradientForest 包的安装和分析步骤。还介绍了相关论文和教程资源,帮助读者深入理解环境数据分析与基因预测。
小明的数据分析笔记本
2024-7-7
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R语言
基于Symbol和ENTREZ ID查询基因注释的R包(easyConvert )
Learn how to annotate genes using the easyConvert R package. Retrieve gene information such as gene aliases, types, Ensembl ID, Entrez ID, and summaries from multiple databases. Install the package and query genes by either NCBI gene ENTREZID or gene symb
生信与基因组学
2024-7-6
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R语言
R语言数据分析入门20问
了解如何使用R语言进行数据分析和制作双坐标图的方法。本文提供20个常见问题,帮助您入门R语言数据分析。查看往期文章以获取更多相关内容。
生信与基因组学
2024-7-6
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R语言
R语言数据分析入门40问
了解如何使用R语言进行数据分析的入门基础问题,包含生成100个高斯(正态)分布随机数的步骤。本文提供R统计学入门的实用问题解答,帮助初学者掌握R语言的基本操作与数据分析技巧。适合想要提升R语言数据分析技能的人士。
生信与基因组学
2024-7-6
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R语言
R语言用指数函数拟合泛基因组曲线
R语言
指数函数拟合
泛基因组
核心基因家族
论文
本文介绍了R语言利用指数函数来拟合泛基因组和核心基因家族曲线的方法,探讨了如何选择拟合函数的初始值,并提供了论文中提到的相关代码示例和R包 ggtrendline 的使用方法。
小明的数据分析笔记本
2024-7-6
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R语言
R语言ggtreeExtra给环形进化树添加热图注释
R语言
ggtreeExtra
环形进化树
热图注释
数据分析
了解如何使用R语言中的ggtreeExtra包,为环形进化树添加热图注释。在该连接中了解更多关于ggtree和ggtreeExtra的安装方法,并查看构建数据集的代码示例。深入挖掘数据分析的细节,通过ggtreeExtra实现更好的结果。
小明的数据分析笔记本
2024-7-5
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R语言
使用R语言复现Nature Cancer论文中的生存分析
R语言
生存分析
数据复现
生物信息学
论文
本文介绍了如何使用R语言复现Nature Cancer论文中的生存分析,并提供了数据复现所需的步骤和代码。同时分享了一些生存分析的R包及作图函数,并附有参考链接,方便读者深入学习。欢迎关注“小明的数据分析笔记本”公众号,获取更多关于R语言和python数据分析、生物信息学以及园艺植物相关转录组学、基因组学、群体遗传学的学习资料和案例。
小明的数据分析笔记本
2024-7-3
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R语言
跟着Nature Communications学数据分析:R语言用分子距离/环境距离/地理距离做mantel检
数据分析
R语言
分子距离
mantel检验
气候脆弱性
本文介绍了使用R语言进行数据分析的方法,包括使用分子距离、环境距离和地理距离进行mantel检验,以探讨遗传变异在气候变化下的脆弱性。另外,文章还提供了相关代码和原始数据,对于对数据分析和基因组学感兴趣的读者来说是一份有价值的学习资料。欢迎关注公众号小明的数据分析笔记本获取更多数据分析和生物信息学方面的内容。
小明的数据分析笔记本
2024-6-28
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R语言
R语言 | 带P值的相关性热图绘制教程
R语言
相关性热图
P值
教程
本教程介绍如何使用R语言绘制带P值的相关性热图,详细步骤和示例数据。如果在MarkDown格式中无法运行成功,请新建一个R script文件,按照教程步骤进行操作。
小杜的生信笔记
2024-6-24
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用R语言的ggplot2包复现一下Nature正刊论文
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使用plink软件+EMMAX软件做GWAS分析的完整
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