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跟着NC学作图:R语言circlize包做弦图展示基因组特征

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赞 · 阅读 270 ·小明的数据分析笔记本 · 2024-07-09 R语言

跟着NC论文学数据分析:R语言gradientForest包分析环境变量的重要性排序

本文详细介绍了如何使用 R 语言中的 gradientForest 包进行环境变量的重要性排序分析，并提供了相关代码和教程链接。内容包括从 VCF 文件计算等位基因频率的方法，如何处理环境数据和等位基因频率表，以及 gradientForest 包的安装和分析步骤。还介绍了相关论文和教程资源，帮助读者深入理解环境数据分析与基因预测。 ...
SNP 位点预测 R 包安装教程
赞 · 阅读 440 ·小明的数据分析笔记本 · 2024-07-07 R语言

基于Symbol和ENTREZ ID查询基因注释的R包（easyConvert ）

Learn how to annotate genes using the easyConvert R package. Retrieve gene information such as gene aliases, types, Ensembl ID, Entrez ID, and summaries from multiple databases. Install the package and query genes by either NCBI gene ENTREZID or gene symb
赞 · 阅读 414 ·生信与基因组学 · 2024-07-06 R语言

R语言数据分析入门20问

了解如何使用R语言进行数据分析和制作双坐标图的方法。本文提供20个常见问题，帮助您入门R语言数据分析。查看往期文章以获取更多相关内容。
赞 · 阅读 233 ·生信与基因组学 · 2024-07-06 R语言

R语言数据分析入门40问

了解如何使用R语言进行数据分析的入门基础问题，包含生成100个高斯（正态）分布随机数的步骤。本文提供R统计学入门的实用问题解答，帮助初学者掌握R语言的基本操作与数据分析技巧。适合想要提升R语言数据分析技能的人士。 ...
赞 · 阅读 220 ·生信与基因组学 · 2024-07-06 R语言

R语言用指数函数拟合泛基因组曲线

本文介绍了R语言利用指数函数来拟合泛基因组和核心基因家族曲线的方法，探讨了如何选择拟合函数的初始值，并提供了论文中提到的相关代码示例和R包 ggtrendline 的使用方法。
R语言 指数函数拟合 泛基因组 核心基因家族 论文
赞 · 阅读 804 ·小明的数据分析笔记本 · 2024-07-06 R语言

R语言ggtreeExtra给环形进化树添加热图注释

了解如何使用R语言中的ggtreeExtra包，为环形进化树添加热图注释。在该连接中了解更多关于ggtree和ggtreeExtra的安装方法，并查看构建数据集的代码示例。深入挖掘数据分析的细节，通过ggtreeExtra实现更好的结果。
R语言 ggtreeExtra 环形进化树 热图注释 数据分析
赞 · 阅读 798 ·小明的数据分析笔记本 · 2024-07-05 R语言

使用R语言复现Nature Cancer论文中的生存分析

本文介绍了如何使用R语言复现Nature Cancer论文中的生存分析，并提供了数据复现所需的步骤和代码。同时分享了一些生存分析的R包及作图函数，并附有参考链接，方便读者深入学习。欢迎关注“小明的数据分析笔记本”公众号，获取更多关于R语言和python数据分析、生物信息学以及园艺植物相关转录组学、基因组学、群体遗传学的学 ...
R语言 生存分析 数据复现 生物信息学 论文
x 1· 赞 · 阅读 559 ·小明的数据分析笔记本 · 2024-07-03 R语言

跟着Nature Communications学数据分析：R语言用分子距离/环境距离/地理距离做mantel检

本文介绍了使用R语言进行数据分析的方法，包括使用分子距离、环境距离和地理距离进行mantel检验，以探讨遗传变异在气候变化下的脆弱性。另外，文章还提供了相关代码和原始数据，对于对数据分析和基因组学感兴趣的读者来说是一份有价值的学习资料。欢迎关注公众号小明的数据分析笔记本获取更多数据分析和生物信息学方面的内 ...
数据分析 R语言 分子距离 mantel检验 气候脆弱性
x 1· 赞 · 阅读 921 ·小明的数据分析笔记本 · 2024-06-28 R语言

R语言 | 带P值的相关性热图绘制教程

本教程介绍如何使用R语言绘制带P值的相关性热图，详细步骤和示例数据。如果在MarkDown格式中无法运行成功，请新建一个R script文件，按照教程步骤进行操作。
R语言 相关性热图 P值 教程
赞 · 阅读 1194 ·小杜的生信笔记 · 2024-06-24 R语言
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