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RNA-seq 详细教程：结果汇总与提取（11）

Learn how to summarize and extract results from RNA-seq data analysis using DESeq2. This tutorial covers evaluating the number of differentially expressed genes, constructing R objects from comparisons, summarizing results using the `summary()` function,
RNA-seq DESeq2 FDR p value
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RNA-seq 详细教程：Wald test（10）

Learn how to generate comparison results using Wald test in RNA-seq with DESeq2. Understand different levels of gene filtering and logarithmic transformation shrinkage to improve log2FoldChange accuracy.
RNA-seq Wald test DESeq2 gene filtering log2FoldChange
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RNA-seq 详细教程：详解DESeq2流程（9）

学习DESeq2的RNA-seq详细教程，掌握差异表达分析过程中重要的步骤和概念，了解变异来源，检查size factors，并对基因水平进行离散估计。深入学习DESeq2流程，提升生物信息学分析能力。
DESeq2教程 RNA-seq 差异表达分析 生物信息学
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RNA-seq 详细教程： `DESeq2` 差异表达分析（7）

学习如何使用DESeq2进行RNA-seq数据的差异表达分析，包括设计公式、统计模型建模和结果解释。了解如何利用DESeq2软件包进行差异表达基因的显著性检验，以及如何控制数据中的变异来源并优化统计模型。
RNA-seq DESeq2 差异表达分析 统计检验 公式设计
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RNA-seq 详细教程：样本质控（6）

Learn how to perform sample quality control in RNA-seq data analysis using PCA analysis and hierarchical clustering. Understand the importance of normalization and transformation methods in RNA-seq data analysis, such as rlog transformation for exploring
RNA-seq tutorial PCA analysis
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RNA-seq 详细教程：count 数据探索（4）

本文为RNA-seq count数据探索教程，介绍了数据的特征、不同数学模型比较、生物学重复设置对于鉴定样本间差异的好处等内容。讨论了计数数据的建模问题，提到了二项分布和泊松分布，同时强调了均值和方差之间的关系。
RNA-seq count 数据 教程 数据特征 统计模型
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RNA-seq 详细教程：搞定count归一化（5）

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RNA-seq（3）

本文介绍了如何使用RNA-seq技术进行转录组差异表达基因和mRNA可变剪切分析，并使用R语言进行数据分析。以MOV10基因的表达为例，详细介绍了数据导入、差异表达基因分析等步骤。
RNA-seq 差异表达基因 转录组分析 R语言数据分析 MOV10基因
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转录组比对番外篇：aligner 与 mapping 区别

本篇文章介绍了转录组比对中的关键术语和软件，包括aligner和mapping的区别，以及STAR、Kallisto和Salmon的特点和优缺点。了解这些内容有助于选择合适的工具进行转录组比对和定量分析。
aligner mapping STAR Kallisto Salmon
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批量FASTQ数据，一键下载解压，下载速度极快 | Kingfisher

Kingfisher软件可以快速下载解压批量FASTQ数据，适用于NCBI数据下载，下载速度极快，使用简单方便。欢迎查阅小杜的生信笔记，了解更多生物信息学教程和数据分析方法。
Kingfisher软件 NCBI下载软件
赞 · 阅读 417 ·小杜的生信笔记 · 2024-06-24 转录组
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