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RNA-seq 差异分析的点点滴滴（3）

本文介绍了RNA-seq数据的差异分析，重点讨论了在使用DESeq2进行转录组分析时可能遇到的问题和解决方法。详细说明了如何使用SummarizedExperiment对象作为输入数据，并展示了导入数据集和分析操作的步骤。
RNA-seq 差异分析 DESeq2 转录组分析
赞 · 阅读 8 ·数据科学工厂 · 2024-11-28 转录组

数据分析的 10 个最佳 Python 库

掌握Python库如Pandas、NumPy、Matplotlib等对数据分析至关重要。学习这些库能提高数据处理效率，进行数据可视化和统计分析。同时使用工具如Scikit-learn进行机器学习，Statsmodels进行统计建模，SciPy进行科学计算，Plotly生成交互式图表，OpenPyXL处理Excel文件，以及BeautifulSoup进行网页数据抓取。通过掌握这些工具， ...
Python库 数据分析 Pandas NumPy Matplotlib
赞 · 阅读 18 ·数据科学工厂 · 2024-11-27 Python

Linux 如何更改默认 Shell

了解如何在Linux中更改用户的默认Shell，包括使用usermod、chsh工具或手动编辑/etc/passwd文件的方法。还可以获取有关安装其他Shell（如Zsh和Fish）的指南。
赞 · 阅读 21 ·数据科学工厂 · 2024-11-26 Linux

R 语言 必备 十大资源

探索R语言在数据科学和统计分析领域的重要性与应用，了解如何利用相关资源提升R编程技能和开展数据分析工作。从R项目官网、哈佛数据科学课程到DataCamp等平台，为初学者和专业人士提供了丰富的学习机会和指导，助力您在数据领域取得成功。 ...
R语言资源 R编程学习 数据科学入门 统计学习教育 R工具推荐
赞 · 阅读 36 ·数据科学工厂 · 2024-11-25 Linux

解码语言：命名实体识别（NER）技术

探索命名实体识别（NER）技术，从规则到深度学习的发展历程，了解如何应用Python库spaCy实践NER，并探索NER在医疗、金融、娱乐等领域的广泛应用及对SEO优化的指导效果。
命名实体识别 NER spaCy 深度学习
赞 · 阅读 33 ·数据科学工厂 · 2024-11-24 机器学习

R中单细胞RNA-seq数据分析教程 (2)

本教程介绍了如何在R中进行单细胞RNA-seq数据分析，包括导入Seurat包、创建Seurat对象等步骤。通过学习这些内容，您可以更好地理解和处理单细胞RNA测序数据。
Seurat包
赞 · 阅读 41 ·数据科学工厂 · 2024-11-23 单细胞测序

Windows 用户应该知道的AppData

了解Windows用户需要知道的AppData文件夹及其三个子目录（Local、LocalLow和Roaming），存放应用程序的特定信息和配置文件，方便解决电脑问题和管理磁盘空间。不同文件夹的功能分别包括存放特定用户的安装文件、应用配置文件、缓存文件等。理解这些文件夹的作用有助于优化程序运行和数据同步。 ...
Windows 用户 AppData 文件夹 个人文件夹 配置文件
赞 · 阅读 46 ·数据科学工厂 · 2024-11-20 Linux

基因组之全局互作热图可视化

PlotHiC是一个专为Hi-C数据可视化分析设计的Python包，可以帮助用户方便地绘制基因组三维结构的热图。使用.hic文件进行操作，无需额外的文件，且操作简便快速。欢迎查看源代码和提交新需求或问题。
Hi-C数据可视化 PlotHiC Python包
x 1· 赞 · 阅读 61 ·数据科学工厂 · 2024-11-18 单细胞测序

R中单细胞RNA-seq数据分析教程 (1)

学习如何在R语言中使用Seurat进行单细胞RNA测序数据分析，包括对来自10x Genomics的数据集进行预处理和分析。本教程适合初学者，涵盖了基本的数据分析流程以及其他工具如presto、destiny、Harmony等的介绍，旨在帮助读者更好地理解和处理单细胞RNA-seq数据。 ...
R语言 Seurat scRNA-seq 10x Genomics
赞 · 阅读 117 ·数据科学工厂 · 2024-11-15 单细胞测序

让你的 环境变量 更合理

了解如何合理设置环境变量，优化PATH路径配置，并通过符号链接管理方式简化系统路径字符串。详细介绍了在不同情况下如何调整PATH变量以提高系统效率和管理用户自定义路径。
环境变量 PATH设置 符号链接管理
赞 · 阅读 56 ·数据科学工厂 · 2024-11-15 Linux
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