利用Arlequin软件计算AMOVA等(一)-使用mega进行序列比对和进化树绘制

基因组 基因组 450 人阅读 | 0 人回复 | 2024-05-09

1 手动将序列改为fasta文件格式,保存至TXT文件中,文件后缀改为.fas

image.png

2 打开mega,将数据导入,多序列比对

image.png

image.png

image.png

image.png

image.png

3 数据保存为mega format格式

image.png

4 在mega首页打开你保存的mega format信息

image.png

image.png

5 一直点ok

6 选择TA

image.png

7 第一个是碱基统计,第二个是替换和颠换

image.png

image.png

8 保守位点、变异位点、pi等信息(最下面是值)

image.png

9 画进化树,第二张图1000是次数,次数越少越准,越多越慢

image.png

image.png

10 进化树结果

image.png

微信扫一扫分享文章

+10
无需登陆也可“点赞”支持作者
分享到:
评论

使用道具 举报

4 积分
4 主题
+ 关注
热门推荐