利用Arlequin软件计算AMOVA等（二）-DNAsp软件和Arlequin软件教程

Bioleader

1 使用DNAsp打开mega比对好的序列

2 打开data-define sequence sets

3 设置分组（这一步比较麻烦），按住键盘上ctrl，鼠标点击样本可以多选，将选中的点击界面的‘>>’按钮，移至右方数据框中，点击add new sequence sets，在弹出的页面中填入分组名

4 所有分组设置完成后，点击update all Entries

5 点击generate-haplotype data file，格式选择arlequin haplotype list，保存文件（会保存两次文件，后缀分别为.hap和.arp，两个文件保存在同一个文件夹下，前缀也相同）

6 打开arlequin，点击open peoject，打开刚刚保存的文件

7 点击structure editor定义组

8 双击group下的0，更改为数字1

9 点击update

10 点击setting，选择响应的分析，默认参数，点击start，之后会跳出一个结果网页

微信扫一扫分享文章