Linux中多线程压缩软件 | Mingz

小杜的生信笔记

一边学习，一边总结，一边分享！

本期教程

软件网址：

https://github.com/hewm2008/MingZ

安装：

git clone https://github.com/hewm2008/MingZ.git
cd MingZ
make
cd bin
./mingz -h

使用源码安装：

若是你的git无法使用安装，也可以只用源码安装。

https://github.com/hewm2008/MingZ/releases/tag/v1.12

安装成功：

添加路径：

vim ~/.bashrc
# 添加路径
PATH=$PATH:~/software/MingZ/bin

# 刷新一下~/.bashrc
source ~/.bashrc

使用：

Usage: mingz  big1.fq *.fq
    Options:
        -i   <str>   input of text file or pipe
        -o   <str>   output of text file
        -t           number of threads [4]
        -c           write on standard output
        -d           decompress(no threads)
        -h           show help hewm2008[v1.10]

例子：压缩

mingz  InA.fq  InB.fq  -o NewOutA.fq.gz   -o NewOutB.fq.gz 
    mingz *.fq   # will remove raw file out InA.fq.gz InB.fq.gz
    mingz  InA.fq  -t  10# muti threads
    cat  InA.fq  | mingz  > NewOutA.fq.gz  ##    cat  InA.fq  | mingz  -o  NewOutA.fq.gz

解压：

mingz In.fq.gz -c -d  > new.Fq
    mingz -i In.Fa.gz -o  OutNew.fq  
    mingz *.gz -d   # will remove raw file

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