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微生物组数据分析利器——Phyloseq学习笔记(一)
WF君
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[md]# 数据导入 ``` # 加载包 library(phyloseq) library(Biostrings) library(tidyverse) ``` .将特征表、分组文件、注释信息导入R中,其中特征表和注释信息需要转换为matrix格式: ``` asvtab % as.matrix() ...
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微生物学
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admin
管理员
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手机版测试一下
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微生物学
微生物组数据分析利器——Phyloseq学习笔记(前言)
WF君
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[md]# phyloseq包 扩增子下机数据在经过上游处理后,最终会生成特征表、注释信息、进化关系、代表性序列以及分组信息等5个文件,这些文件需要逐个导入R中,用于后续的统计分析过程中。而phyloseq包可以将5个文件打 ...
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